近日，果樹所荔枝種質資源與育種團隊在國際學術期刊Genome Biology（中科院生物學一區top，IF=9.4）發表題為“Comprehensive genomic and phenotypic analyses reveal the genetic basis of fruit quality in litchi”的研究論文。果樹所為論文第一完成單位，果樹所嚴倩副研究員、中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所馮筠庭副研究員和果樹所陳潔珍副研究員為論文共同第一作者，華南農業大學夏瑞教授和果樹所歐良喜研究員為論文共同通訊作者，果樹所文英傑博士，華中農業大學博士生黃刊，華南農業大學麥迎曉博士和郝彥偉副教授參與該項工作。

　　在本研究中，對來自國家荔枝種質資源圃（廣州）從全球收集的276份具有代表性荔枝種質資源進行了重測序，構建了迄今為止荔枝（乃至整個無患子科）最全麵的遺傳變異圖譜。通過對21個果實品質相關性狀進行表型分析，進一步結合全基因組關聯研究，鑒定了總計460個與果實性狀顯著相關的SNP和1,807個候選基因。利用高效液相色譜（HPLC）方法測定了190個荔枝品種果實的糖組分和含量，通過比較LcSAI蔗糖和還原糖種質中的差異，開發了一個與糖組分和含量緊密連鎖的分子標記，可用於荔枝育種的早期篩選，縮短育種周期。本研究揭示了荔枝的遺傳多樣性和群體結構，通過全麵的基因組分析和表型分析，闡明了果實品質的遺傳基礎。

　　該研究得到廣東省重點領域研發計劃(2022B0202070003)，國家自然科學基金(#32102333,#32072547和#32102320)，廣西壯族自治區科技重大專項(Grant No.GuikeAA23023007-2)，廣東省自然科學基金(2021A1515011031)，國家荔枝龍眼產業技術體係(CARS-32-01)等項目的資助。

　　原文鏈接：https://doi.org/10.1186/s13059-025-03693-5